Privet Drive'da geçen yalnız bir yazın ardından Harry (Daniel Radcliffe), talihsizliklerle dolu bir Hogwarts'a geri döner. Öğrencilerin ve velilerin çok azı, Voldemort'un (Ralph Fiennes) gerçekten döndüğü konusunda ona veya Dumbledore'a (Sir Michael Gambon) inanmaktadır. Bakanlık, Hogwarts'a Harry'nin hayatında karşılaştığı en çekilmez insan olduğunu kanıtlayan Profesör Dolores Umbridge (Imelda Staunton) adında yeni bir Karanlık Sanatlara Karşı Savunma öğretmeni atayarak duruma müdahale etmeye karar vermiştir. Harry aynı zamanda güzel Cho Chang'e (Katie Leung) kaçamak bakışlar atmaktan da kendini alamaz. Tüm bunların tuzu biberi ise Harry'nin açıklayamadığı rüyalar ve Voldemort'un aradığı bir şeyin ardındaki gizemdir. Bu kadar çok sorunla birlikte Harry, Hogwarts Cadılık ve Büyücülük Okulu'ndaki en zorlu yıllarından birine başlar.