Bu ikinci macerada Neo ve asi liderler, Zion'un Makine Ordusu tarafından kuşatılmasına 72 saat kaldığını tahmin etmektedir. Dünyadaki son insan sığınağını, insanlığı yok etmeye programlanmış 250.000 Gözcü'den ayıran şey sadece birkaç saattir. Ancak Seçilmiş Kişi'nin Kahve'nin Kehaneti'ni gerçekleştirip Makinelerle olan savaşı bitireceğine dair Morpheus'un taşıdığı inançla cesaret bulan Zion sakinleri, tüm umut ve beklentilerini Neo'ya bağlar; Neo ise bir eylem planı ararken rahatsız edici rüyalarla hareket edemez hâlde kalır.
