Thomas A. Anderson iki farklı hayat yaşayan bir adamdır; gündüzleri sıradan bir bilgisayar programcısı, geceleri ise Neo olarak bilinen bir bilgisayar korsanıdır. Neo realitesini her zaman sorgulamıştır ancak gerçek, onun hayal gücünün çok ötesindedir. Hükûmet tarafından terörist olarak damgalanmış efsanevi bir bilgisayar korsanı olan Morpheus kendisiyle iletişime geçtiğinde Neo, kendisini polisin hedefinde bulur. Makinelere karşı bir asi olarak Neo; kendisini ve tüm insanlık isyanını durdurmaya adanmış, süper güçlü bilgisayar programları olan ajanlarla karşı karşıya gelmek zorundadır.
