Belirgin sanrılardan muzdarip olan ve Matrix (1999) video oyunu serisinin ödüllü yaratıcısı Thomas Anderson, artık içindeki şeytanları dizginlemek için güçlü mavi haplara güvenmektedir. Derken, açıklanamaz ve gerçekliğe meydan okuyan vizyonların ortasında Thomas, tanıdık gelen ama tamamen yabancı olan ve tuhaf duygular uyandıran Tiffany'yi fark eder; bu durum, zaten kırılgan olan ruhsal durumunun daha da kötüleşmeye başlamasına yol açar. Bay Anderson, depresyonun eşiğinde yalpalar bir hâlde bir açıklama özlemi çekerken bir kez daha acil bir ikilemle ve seçim yapmanın yüküyle karşı karşıya kalır. Bir yanda, cehaletin getirdiği mutluluk güven illüzyonunu garanti etmektedir; diğer yanda ise gerçekliğin dayanılmaz doğrusu yalnızca tek bir anlama gelebilir: Kusursuzca işlenmiş Matrix, hayal gücünün sınırlarının ötesine geçmektedir. Fakat Thomas, ne yapması gerektiğini bir şekilde zaten bilmektedir; yine de tavşan deliğinin ne kadar derine gittiğini gerçekten öğrenmek istemekte midir?